MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014002	CTT	2	6	231130	231135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494888
4502	NC_014002	CCA	2	6	231145	231150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494888
4503	NC_014002	TCCA	2	8	231162	231169	25 %	25 %	0 %	50 %	294494888
4504	NC_014002	AAG	2	6	231199	231204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494888
4505	NC_014002	GAT	2	6	231299	231304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494888
4506	NC_014002	GAT	2	6	231306	231311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494888
4507	NC_014002	AT	3	6	231310	231315	50 %	50 %	0 %	0 %	294494888
4508	NC_014002	TTGAA	2	10	231367	231376	40 %	40 %	20 %	0 %	294494888
4509	NC_014002	TTG	2	6	231420	231425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494888
4510	NC_014002	ATA	2	6	231473	231478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494888
4511	NC_014002	ACA	2	6	231506	231511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_014002	CAT	2	6	231519	231524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_014002	TCT	2	6	231539	231544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_014002	T	6	6	231579	231584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_014002	AT	3	6	231707	231712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_014002	GGA	2	6	231755	231760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494889
4517	NC_014002	TTC	2	6	231777	231782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494889
4518	NC_014002	GAT	2	6	231785	231790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494889
4519	NC_014002	ACA	2	6	231827	231832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494889
4520	NC_014002	A	6	6	231856	231861	100 %	0 %	0 %	0 %	294494889
4521	NC_014002	CAA	2	6	231918	231923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494889
4522	NC_014002	CATA	2	8	232043	232050	50 %	25 %	0 %	25 %	294494889
4523	NC_014002	TGG	2	6	232054	232059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494889
4524	NC_014002	GAA	2	6	232079	232084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494889
4525	NC_014002	CTTC	2	8	232140	232147	0 %	50 %	0 %	50 %	294494889
4526	NC_014002	AAT	2	6	232189	232194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494889
4527	NC_014002	GA	3	6	232259	232264	50 %	0 %	50 %	0 %	294494889
4528	NC_014002	ACT	2	6	232268	232273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494889
4529	NC_014002	TGAG	2	8	232560	232567	25 %	25 %	50 %	0 %	294494889
4530	NC_014002	GGA	2	6	232583	232588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494889
4531	NC_014002	GTG	2	6	232635	232640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494889
4532	NC_014002	AGC	2	6	232708	232713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494889
4533	NC_014002	CTTT	2	8	232800	232807	0 %	75 %	0 %	25 %	294494889
4534	NC_014002	AGC	2	6	233035	233040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494889
4535	NC_014002	GGTG	2	8	233044	233051	0 %	25 %	75 %	0 %	294494889
4536	NC_014002	GTT	2	6	233234	233239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494889
4537	NC_014002	TAT	2	6	233284	233289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494889
4538	NC_014002	ATT	2	6	233300	233305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494889
4539	NC_014002	AAG	2	6	233362	233367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494889
4540	NC_014002	TAC	2	6	233417	233422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494889
4541	NC_014002	AAG	2	6	233561	233566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494889
4542	NC_014002	ATA	2	6	233618	233623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494889
4543	NC_014002	TTTTTC	2	12	233671	233682	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4544	NC_014002	AT	3	6	233692	233697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_014002	AT	3	6	233828	233833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_014002	GGT	2	6	233858	233863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_014002	T	6	6	233933	233938	0 %	100 %	0 %	0 %	294494890
4548	NC_014002	T	6	6	234010	234015	0 %	100 %	0 %	0 %	294494890
4549	NC_014002	GTT	2	6	234040	234045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494890
4550	NC_014002	TCC	2	6	234055	234060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4551	NC_014002	TGT	2	6	234061	234066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_014002	T	6	6	234066	234071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_014002	TATT	2	8	234092	234099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_014002	TATT	2	8	234225	234232	25 %	75 %	0 %	0 %	294494891
4555	NC_014002	TGC	2	6	234266	234271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494891
4556	NC_014002	TC	3	6	234283	234288	0 %	50 %	0 %	50 %	294494891
4557	NC_014002	AGC	2	6	234311	234316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494891
4558	NC_014002	C	6	6	234331	234336	0 %	0 %	0 %	100 %	294494891
4559	NC_014002	TTG	2	6	234340	234345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494891
4560	NC_014002	GGT	2	6	234375	234380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494891
4561	NC_014002	AAG	2	6	234483	234488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494891
4562	NC_014002	TGA	2	6	234497	234502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494891
4563	NC_014002	GAA	2	6	234609	234614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494891
4564	NC_014002	AG	3	6	234717	234722	50 %	0 %	50 %	0 %	294494891
4565	NC_014002	GAA	2	6	234753	234758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494891
4566	NC_014002	TCA	2	6	234769	234774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494891
4567	NC_014002	CAG	2	6	234870	234875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494891
4568	NC_014002	AT	3	6	235068	235073	50 %	50 %	0 %	0 %	294494891
4569	NC_014002	GCA	2	6	235123	235128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494891
4570	NC_014002	CAG	2	6	235302	235307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494891
4571	NC_014002	TA	3	6	235317	235322	50 %	50 %	0 %	0 %	294494891
4572	NC_014002	T	6	6	235337	235342	0 %	100 %	0 %	0 %	294494892
4573	NC_014002	GTT	3	9	235358	235366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494892
4574	NC_014002	ATC	2	6	235429	235434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494892
4575	NC_014002	GAA	2	6	235459	235464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494892
4576	NC_014002	GCA	2	6	235473	235478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494892
4577	NC_014002	T	6	6	235515	235520	0 %	100 %	0 %	0 %	294494892
4578	NC_014002	CTT	2	6	235548	235553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494892
4579	NC_014002	GAG	2	6	235674	235679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494892
4580	NC_014002	TCT	2	6	235711	235716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494893
4581	NC_014002	TCT	2	6	235738	235743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494893
4582	NC_014002	AT	3	6	235835	235840	50 %	50 %	0 %	0 %	294494893
4583	NC_014002	TG	3	6	236001	236006	0 %	50 %	50 %	0 %	294494893
4584	NC_014002	ATT	2	6	236028	236033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_014002	ATC	2	6	236091	236096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_014002	CCT	2	6	236155	236160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4587	NC_014002	TA	3	6	236264	236269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_014002	TTA	2	6	236301	236306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494894
4589	NC_014002	GA	3	6	236308	236313	50 %	0 %	50 %	0 %	294494894
4590	NC_014002	GGC	2	6	236342	236347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494894
4591	NC_014002	ATC	2	6	236399	236404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494894
4592	NC_014002	GAAA	2	8	236475	236482	75 %	0 %	25 %	0 %	294494894
4593	NC_014002	ATA	2	6	236502	236507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494894
4594	NC_014002	TTGC	2	8	236537	236544	0 %	50 %	25 %	25 %	294494894
4595	NC_014002	GTT	2	6	236621	236626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494894
4596	NC_014002	GCT	2	6	236643	236648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494894
4597	NC_014002	ATT	2	6	236651	236656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494894
4598	NC_014002	GAG	2	6	236750	236755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494894
4599	NC_014002	TTCC	2	8	236765	236772	0 %	50 %	0 %	50 %	294494894
4600	NC_014002	TC	4	8	236830	236837	0 %	50 %	0 %	50 %	294494894
4601	NC_014002	AAG	2	6	236886	236891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494894
4602	NC_014002	AGA	2	6	236908	236913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494894
4603	NC_014002	CTT	2	6	236955	236960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494894
4604	NC_014002	CTG	2	6	236984	236989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494894
4605	NC_014002	AGC	2	6	236998	237003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494894
4606	NC_014002	GAT	2	6	237017	237022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494894
4607	NC_014002	GCA	2	6	237049	237054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_014002	GCT	2	6	237061	237066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_014002	CT	3	6	237065	237070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_014002	GT	3	6	237224	237229	0 %	50 %	50 %	0 %	294494895
4611	NC_014002	GCT	2	6	237260	237265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494895
4612	NC_014002	GACC	2	8	237269	237276	25 %	0 %	25 %	50 %	294494895
4613	NC_014002	TC	3	6	237284	237289	0 %	50 %	0 %	50 %	294494895
4614	NC_014002	TTC	2	6	237348	237353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494895
4615	NC_014002	TAG	2	6	237364	237369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494895
4616	NC_014002	TCT	2	6	237379	237384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494895
4617	NC_014002	CCG	2	6	237556	237561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494895
4618	NC_014002	TGT	2	6	237593	237598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494895
4619	NC_014002	TTC	2	6	237657	237662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494895
4620	NC_014002	CAT	2	6	237663	237668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494895
4621	NC_014002	ACC	2	6	237690	237695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494895
4622	NC_014002	GAG	2	6	237736	237741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494895
4623	NC_014002	CTT	2	6	237830	237835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494895
4624	NC_014002	CCTT	2	8	237844	237851	0 %	50 %	0 %	50 %	294494895
4625	NC_014002	CAA	2	6	237854	237859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494895
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4729	NC_014002	AT	3	6	243788	243793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4866	NC_014002	AAT	2	6	250913	250918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4999	NC_014002	ATA	2	6	259117	259122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494915
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